Um projeto inicial desenvolvido por 3 ACIs - Associações Comerciais e Industriais, do Estado de Santa Catarina, Blumenau, Brusque e Joinville, com o apoio do Governo Alemão, através da HWK - Câmara de Artes e Ofícios de Munique e Alta Baviera, a partir de 1991, foi embrião do Projeto Empreender. As primeiras ACIs participantes, com o suporte da HWK, criaram uma entidade, a Fundação Empreender, para desenvolver a metodologia e disseminá-la no Brasil e na América Latina. O resultado obtido por essa experiência inicial, levou a FACISC - Federação das Associações Comerciais e Industriais de Santa Catarina e o SEBRAE/SC, com o apoio financeiro do SEBRAE/NA, a partir de 1997, implantar em outros municípios do estado. A partir de 1999, o SEBRAE Nacional e a CACB - Confederação das Associações Comerciais do Brasil, iniciaram a implantação piloto do projeto Empreender em mais 7 estados brasileiros: AL, BA, MA, MG, PE, PR e SE.

Ao final de 2001, o projeto encontrava-se implantado em 210 municípios, de 8 estados, beneficiando diretamente 12.183 micro e pequenas empresas, distribuídas em 901 Núcleos Setoriais. A partir de 2002, iniciou-se a expansão do Empreender para todas as 27 unidades da Federação, com a meta de atingir mais 650 municípios e beneficiar outras 32.500 MPE - micro e pequenas empresas, em 3.250 novos Núcleos Setoriais.

Em 2002, a Facesp teve sua parceria com o Sebrae/NA e a CACB e seu Projeto teve início em 116 municípios. Com um ano de resultados positivos, no ano de 2003 uma parceria com o Sebrae/SP implantou-se o Projeto em mais 80 municípios, totalizando 196 municípios dentro do estado de São Paulo. Atualmente possuímos aproximadamente 600 núcleos setoriais e 6500 empresários participando do Empreender.